Trẻ PVF CAND không được tham dự Cúp Quốc gia vì cùng đơn vị chủ quản với PVF- CAND.
Giải bóng đá Cúp Quốc gia 2025/26 quy tụ 26 CLB chuyên nghiệp trong cả nước, bao gồm 14 đội ở V.League là Becamex TP.HCM, Công An Hà Nội, Công An TP.HCM, Đông Á Thanh Hóa, Hoàng Anh Gia Lai, Hà Nội, Hải Phòng, Hồng Lĩnh Hà Tĩnh, Ninh Bình, PVF-CAND, SHB Đà Nẵng, Sông Lam Nghệ An, Thép Xanh Nam Định và Thể Công Viettel.
Cùng 12 đội ở hạng Nhất Quốc gia, gồm: Trường Tươi Đồng Nai (tên cũ là Trường Tươi Bình Phước), Trẻ TP.HCM, Long An, Khánh Hòa, CLB TP.HCM (tên cũ là Bà Rịa Vũng Tàu), Quy Nhơn Bình Định, Hòa Bình, Đồng Tháp, Đại học Văn Hiến, Gia Định, Quảng Ninh và Bắc Ninh.

Trẻ PVF CAND là đội bóng duy nhất ở giải hạng Nhất không tham dự do cùng đơn vị chủ quản với PVF- CAND thi đấu tại V.League 2025/26. Theo đó, PVF CAND là đội đồng ý nhận lời mời chuyển từ hạng Nhất lên V-League mùa này sau khi CLB Quảng Nam giải thể. Mùa trước, PVF CAND xếp hạng 3 ở giải hạng Nhất 2024/2025.
So với mùa trước, hạng Nhất có sự thay đổi khi Ninh Bình lên hạng, Huế phải xuống chơi ở giải hạng Nhì, Đồng Nai giải thể. 4 đội từ hạng Nhì lên hạng Nhất là Quảng Ninh, Bắc Ninh, Đại học Văn Hiến và Gia Định. Sau đó PVF CAND nhận lời lên V-League nên suất tham dự giải hạng Nhất đó được chuyển cho Trẻ PVF CAND (1 trong 2 đội xếp hạng 3 ở giải hạng Nhì mùa trước).

Cúp Quốc gia 2025/26 dự kiến khởi tranh ngày 13/9/2025 và trận chung kết diễn ra ngày 28/6/2026. CLB đoạt Cúp Quốc gia nhận giải thưởng có giá trị 2 tỷ đồng.
Điểm mới nổi bật tại Giải hạng Nhất 2025/26, mỗi CLB tham dự được quyền đăng ký tối đa 01 cầu thủ người nước ngoài, 01 cầu thủ Việt Nam gốc nước ngoài và 02 cầu thủ nước ngoài gốc Việt Nam. Như vậy quy định này cũng sẽ được áp dụng khi có 1 đội V-League gặp 1 đội hạng Nhất ở Cúp Quốc gia.
Để nâng cao chất lượng chuyên môn, hình ảnh cho các giải đấu, Công ty VPF sẽ tiếp tục triển khai, áp dụng công nghệ VAR tại một số vòng đấu, trận đấu quan trọng của Giải Hạng Nhất Quốc gia và Giải bóng đá Cúp Quốc gia 2025/26.